后北条氏重新制霸关东后不久，就爆发了第二次国府台合战。这次合战的双方统帅，正好都是第一次国府台合战的两位主角的儿子，即北条氏纲的儿子氏康和里见义尧的儿子义弘。

永禄六年（1563年），上杉谦信再次关东出阵，攻击常陆土浦城主小田氏治，他同时请求上总的里见氏和武藏岩付的太田氏出兵协助。于是里见义尧派其子义弘，并太田三乐斋资正进攻后北条氏。

太田资正暗中联络族叔、江户城主太田康资，请他离开后北条氏的阵营，献出江户城来。此太田康资乃是太田道灌嫡派的曾孙，早就对后北条氏心怀不满，于是双方商定，只等北条氏康出兵救援小田氏，他即夺取江户城，切断后北条军的退路。

然而北条氏康何如人也，这样发生在眼皮底下的阴谋他岂有看不见之理？结果还没等他离开小田原，太田康资的计划就败露了，被迫逃出江户城，往投岩付太田资正。为了接应康资，太田、里见联军匆忙西进，列阵于国府台地区。

次年（1564年）正月，北条氏康、氏政父子亲自上阵，以猛将北条纲成为先锋，以氏康的另外两个儿子氏照、氏邦，以及大道寺直家为合后，统率两万大军，浩浩荡荡杀往国府台。太田、里见联军以逸待劳，没等后北条势站稳脚跟，就挥军掩杀过去。后北条方乱成一团，名将远山纲景、景久父子、富永政家等先后战死，多亏北条纲成阻遏追兵，勇猛奋战，才避免全军皆溃的命运。

双方激战整整一天，直到暮色四合才各自收兵。太田、里见联军打了胜仗，不免摆宴庆功，松懈了防备。而北条氏康就趁着这个机会，于夜半时分冒着浠浠沥沥的小雨，悄悄潜至联军背后。一声号响，后北条军汹涌杀来，联军大溃，里见义弘等人突破重围，好不容易才逃得了一条性命。

就这样，第二次国府台合战又以后北条氏的胜利而告终，据说这仗里见、太田联军死伤五千三百余人，后北条氏方死伤三千七百余人，在冷兵器时代，这一伤亡比率是相当可观了。北条氏康趁胜追击，突入上总国，逼近里见氏主城久留里，连里见氏的重臣正木时忠都弃甲被迫归降。

这一仗几乎宣告了南总名门里见氏的灭亡，不过好在英主里见义尧还在，费尽心机才熬过了苦日子。至于里见义弘，他后来继承义尧为家督，鼓励百姓“落书”（就代官贪污害民等事，直接向家主上书），可以说是一位贤君，但他在战略战术上却能力偏低，被迫与后北条氏和睦，在争雄关东方面，可算是彻底地沉寂了下来。

不过北条氏康也并没能高兴太久，上杉谦信的势力被他逐渐驱逐出关东，但前门拒狼，后门进虎，永禄十一年（1568年），武田信玄悍然撕毁甲骏相三国盟约，出兵骏河。后北条氏派兵增援骏河今川氏，反被强大的武田军越过国境，一直杀到小田原城下。

此时北条氏康已经退位，把守护之职让给了长子氏政。他急忙和上杉谦信达成合议，即所谓“越相同盟”，然后仍采用对付越后军的老办法，收缩防线，死守小田原。小田原城高堞密，上杉谦信无力攻克，武田信玄也只能望而兴叹。

北条氏康还想出一条毒计，联合今川氏停止了对武田氏的海盐供应，并在边界布置重兵缉拿私商。甲信都是平原和山区，不靠海，海盐供应一断绝，武田信玄差点儿没当场愁死。然而正在危急关头，越后竟然送来了海盐。上杉谦信写信给信玄说：“我与公战，以刀剑，不以食盐。”